การบริหารจัดการน้ำเป็นองค์ประกอบที่สำคัญที่สุดในการทำฟาร์มสัตว์ เพื่อให้ได้ผลผลิตสูงสุด จึงต้องเอาใจใส่เป็นพิเศษในการดูแลแหล่งน้ำที่สัตว์จะต้องบริโภคเข้าไป สัตว์จะกินน้ำในปริมาณ 2-5 เท่าของอาหารโดยขึ้นอยู่กับสภาพอากาศ ดังนั้นในการเลี้ยงสัตว์ถึงแม้จะมีอาหารที่ดีและการจัดการฟาร์มที่ดีแล้วก็ตาม แต่หากสัตว์ยังกินน้ำที่ไม่สะอาดพอก็คงหลีกไม่พ้นที่จะต้องป่วยหรือมีการเจริญเติบโตที่ด้อยลงไปอย่างแน่นอน โดยส่วนใหญ่น้ำที่ใช้ในการเลี้ยงสัตว์คงหนีไม่พ้นที่จะเป็นน้ำจากใต้ดิน